Calor
É a energia térmica em movimento.
O calor é uma das duas formas disponíveis para se transferir energia de um sistema a outro e expressa a quantidade de energia transferida através da fronteira comum aos sistemas. O calor descreve a energia transferida entre sistemas que não se pode associar à execução de um trabalho mecânico, este último correspondendo à segunda entre as duas formas de transferência de energia citadas.

Temperatura:
É a medida do grau de agitação das moléculas de um corpo e calor é a energia térmica em trânsito, isto é, a energia transferida de um corpo para outro quando existe diferença de temperatura entre eles.

Fontes:
http://www.efeitojoule.com/2009/01/temperatura-calor-e-temperatura.html.
http://pt.wikipedia.org/wiki/Calor.
http://www.mundovestibular.com.br/articles/1140/1/CALOR/Paacutegina1.html